Организация квантовохимических расчетов с использованием пакета Firefly в гетерогенной грид-системе на базе BOINC

Авторы

  • Н.Н. Никитина
  • Е.Е. Ивашко

Ключевые слова:

BOINC
Firefly
распределенные вычисления
грид

Аннотация

Рассмотрен опыт проведения большого числа вычислительных экспериментов на базе гетерогенной грид-системы под управлением программной платформы BOINC. Для проведения квантовохимических расчетов использован программный пакет Firefly, адаптированный для выполнения в распределенной среде с помощью программы-«обертки» GenWrapper. Постановка заданий производилась через специальный web-интерфейс доступа к грид-сегменту.

Новые вычислительные технологии

Загрузки

Опубликован

2012-09-23

Выпуск

Том 13 (2012): Выпуск 1.

Раздел

Раздел 2. Программирование

Авторы

Н.Н. Никитина

Институт прикладных математических исследований Карельского научного центра РАН (ИПМИ КарНЦ РАН)
ул. Пушкинская, 11, 185910, Петрозаводск
• стажер-исследователь

Е.Е. Ивашко

Институт прикладных математических исследований Карельского научного центра РАН (ИПМИ КарНЦ РАН)
ул. Пушкинская, 11, 185910, Петрозаводск
• научный сотрудник

Библиографические ссылки

  1. Kamra V., Chugh A. TCP/IP security protocol suite for grid computing architecture // Communications in Computer and Information Science. 2011. Part 1. 169. 30-35.
  2. Foster I., Kesselman C. The grid: blueprint for a new computing infrastructure. San Francisco: Morgan Kaufmann Publishers, 2004.
  3. Condor. High Throughput Computing (http://www.cs.wisc.edu/condor).
  4. The Globus Toolkit (http://www.globus.org/toolkit).
  5. UNICORE - Distributed Computing and Data Resources (http://www.unicore.eu).
  6. BOINC: Программное обеспечение с открытым исходным кодом для организации добровольных распределенных вычислений и распределенных вычислений в сети (http://boinc.berkeley.edu/index.php).
  7. Семейство программ X-Com (http://x-com.parallel.ru/).
  8. Центр высокопроизводительной обработки данных ЦКП КарНЦ РАН. Институт прикладных математических исследований Карельского научного центра РАН (http://cluster.krc.karelia.ru).
  9. Проект добровольных вычислений Climateprediction.net (http://climateprediction.net).
  10. Проект добровольных вычислений SETI@home (http://setiathome.berkeley.edu).
  11. Проект добровольных вычислений Einstein@home (http://einstein.phys.uwm.edu).
  12. Marosi A.C., Balaton Z., Kacsuk P. GenWrapper: a generic wrapper for running legacy applications on desktop grids // 3rd Workshop on Desktop Grids and Volunteer Computing Systems (PCGrid 2009). Rome, 2009.
  13. Granovsky A.A. Firefly version 7.1.G (http://classic.chem.msu.su/gran/firefly/index.html).
  14. Schmidt M.W., Baldridge K.K., Boatz J.A., Elbert S.T., Gordon M.S., Jensen J.H., Koseki S., Matsunaga N., Nguyen K.A., Su S., Windus T.L., Dupuis M., Montgomery J.A. General atomic and molecular electronic structure system // J. Comput. Chem. 1993. 14. 1347-1363.
  15. Кременецкий В.Г., Кременецкая О.В., Кузнецов С.А., Калинников В.Т. Квантово-химический подход к оценке состава устойчивых комплексных частиц в расплавах галогенидов щелочных металлов // Докл. РАН. 2011. 437, № 6. 782-784.
  16. Stulov Yu.V., Kremenetsky V.G., Kremenetskaya O.V., Fofanov A.D., Kuznetsov S.A. Standard rate constants of charge transfer for the redox couple Cr(III)/Cr(II) in chloride melts: experiment and calculation // Proc. 9th Int. Frumkin Symp. Electrochemical Technologies and Materials for XXI Century. Moscow, 2010.