Динамически формируемые параллельные среды в условиях грид-полигоноа: проблемы и решения
Авторы
-
В.М. Волохов
-
Д.А. Варламов
-
А.В. Пивушков
-
Н.Ф. Сурков
-
Д.А. Варламов
Ключевые слова:
распределенные вычисления
грид
виртуализация
MPI
вычислительная и квантовая химия
GAMESS-US
Аннотация
Статья посвящена анализу проблем выполнения сложно сконфигурированных параллельных прикладных пакетов в распределенных средах и описанию некоторых способов разрешения подобных проблем. Описаны методы создания и запуска в различных грид-средах (gLite, Unicore, Globus GT4) динамически формируемых ("виртуальных") параллельных сред исполнения для обеспечения запуска параллельных прикладных задач. Разработанные методы позволяют запускать сложные, требующие предустановки и настройки кластера, параллельные приложения на не сконфигурированных заранее произвольных ресурсах грид-полигонов. Приведены примеры реализации данного метода для квантово-химического пакета GAMESS-US на различных грид-полигонах в условиях всех трех вышеупомянутых сред. Работа выполнена при поддержке РФФИ, грант № 11-07-00686-a. Статья подготовлена по материалам доклада авторов на международной научной конференции «Параллельные вычислительные технологии» (ПаВТ-2011; http://agora.guru.ru/pavt2011).
Раздел
Раздел 2. Программирование
Библиографические ссылки
- Волохов В.М., Варламов Д.А., Пивушков А.В., Покатович Г.А., Сурков Н.Ф. Технологии ГРИД в вычислительной химии // Вычислительные методы и программирование. 2010. 11, № 1. 175-182.
- Волохов В.М., Варламов Д.А., Сурков Н.Ф., Пивушков А.В. Виртуальные вычислительные среды: использование на GRID полигонах // Вестник ЮУрГУ. Cер. Математическое моделирование и программирование. 2009. № 17 (150). Вып. 3. 24-35.
- Варламов Д.А., Волохов В.М., Пивушков А.В., Сурков Н.Ф. Виртуализация параллельных приложений квантовой химии для запуска на ресурсных узлах распределенных сред // 3-я Межд. науч. конф. «Суперкомпьютерные системы и их применение». SSA’2010. Минск, 2010. 2. 12-16.
- Варламов Д.А., Волохов В.М., Пивушков А.В., Сурков Н.Ф. Виртуализация вычислительной среды в ГРИД // «Параллельные вычислительные технологии 2010» (ПаВТ-2010), Уфа, март 2010. Челябинск: Изд-во ЮУрГУ, 2010. 63-70.
- Волохов В.М., Пивушков А.В., Сурков Н.Ф., Варламов Д.А., Волохов А.В. Новые методы решения задач вычислительной химии в распределенных средах // «Научный сервис в сети Интернет: суперкомпьютерные центры и задачи.’’ 20-25 сентября 2010, Новороссийск. М.: Изд-во Моск. гос. ун-та, 2010. 181-184.
- Волохов В.М., Пивушков А.В., Волохов А.В., Варламов Д.А. Реализация нескольких независимых ресурсных грид-сайтов на едином физическом пространстве кластера // X Межд. конф. «Высокопроизводительные параллельные вычисления на кластерных системах». HPC-2010. Пермь, 2010. 1. 119-124.