GRID и вычислительная химия
Авторы
-
В.М. Волохов
-
Д.А. Варламов
-
А.В. Пивушков
-
Н.Ф. Сурков
-
Г.А. Покатович
Ключевые слова:
распределенные вычисления
квантовая и вычислительная химия
GRID
Аннотация
В ИПХФ РАН создан и эксплуатируется ресурсный GRID-центр, включающий в себя узлы на основе middleware gLite и Unicore, разработаны прикладные программные интерфейсы различного уровня для запуска в распределeнной вычислительной среде однопроцессорных и параллельных приложений в области вычислительной химии. Создан метод подготовки широкого класса задач вычислительной химии, включающий технику подготовки, формирования параллельных «пучков» задач, их запуска на распределенных ресурсах и последующей «сборки» результатов. Для многопараметрических задач и пакета GAMESS реализованы пользовательские WWW-интерфейсы в составе Web-портала GECP (grid.icp.ac.ru, Grid Enabled Chemical Physics). Статья подготовлена по материалам доклада авторов на международной конференции «Параллельные вычислительные технологии» (ПаВТ-2009; http://agora.guru.ru/pavt).
Раздел
Раздел 2. Программирование
Библиографические ссылки
- Волохов В.М., Варламов Д.А., Пивушков А.В. Крупномасштабные задачи химии на параллельных и распределенных вычислительных полигонах: современное состояние и перспективы // «Научный сервис в сети Интернет: решение больших задач». Труды Всероссийской научной конференции. Новороссийск. М.: Изд-во Моск. ун-та, 2008. 210-212.
- Алдошин С.М., Варламов Д.А., Волохов В.М., Покатович Г.А., Сурков Н.Ф., Станиловский А.И. GRID и вычислительная химия в ИПХФ РАН // «Научный сервис в сети Интернет: технологии параллельного программирования». Труды Всероссийской научной конференции. Новороссийск. М.: Изд-во Моск. ун-та, 2006. 91-93.
- Варламов Д.А., Волохов В.М., Пивушков А.В., Сурков Н.Ф., Покатович Г.А. Распределенные и параллельные вычисления в области химии на ресурсном узле ГРИД ИПХФ РАН // The Third Int. Conf. on Distributed Computing and GRID Technologies in Science and Education. Дубна: Изд-во ОИЯИ, 2008. 120-122.
- Алдошин С.М., Волохов В.М., Варламов Д.А., Пивушков А.В. Вычислительная химия в среде GRID: параллельные и распределенные вычисления // Труды Второй международной конференции «Суперкомпьютерные системы и их применение SSA’2008». Минск: ОИПИ НАН Беларуси, 2008. 114-118.
- Волохов В.М., Алдошин С.М., Варламов Д.А., Пивушков А.В. Использование GRID технологий для исследования структуры и свойств наноматериалов // Distributed Computing and Grid-Technologies in Science and Education. Extended Proceedings of the 3rd Intern. Conf. Дубна: Изд-во ОИЯИ, 2008. 131-136.
- Варламов Д.А., Волохов В.М., Покатович Г.А., Сурков Н.Ф., Пивушков А.В. Российский сегмент GRID в области вычислительной химии // «Распределенные вычисления и Грид-технологии в науке и образовании». Труды второй международной конференции. Дубна: Изд-во ОИЯИ, 2006. 243-254.